RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 RIN1Q13671 783 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 CARTPTQ16568 116 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 SFXN4Q6P4A7 337 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 SPACA5Q96QH8 159 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 GFI1Q99684 422 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 EGLN1Q9GZT9 426 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 IL19Q9UHD0 177 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa13.46□□□□□ -0.25
IFT20-201ENST00000322326 A0A0G2JK05 382 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 IFITM5A6NNB3 132 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 AIPO00170 330 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 SLC17A2O00624 439 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CYB5AP00167 134 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 HTR2CP28335 458 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 HAAOP46952 286 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 POU3F4P49335 361 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CAPZA1P52907 286 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CAV3P56539 151 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 RAB11BQ15907 218 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 DGUOKQ16854 277 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 AP3S1Q92572 193 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 RFT1Q96AA3 541 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 MEGF10Q96KG7 1140 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 OR2V2Q96R30 315 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 S100A13Q99584 98 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 DAPK2Q9UIK4 370 aa13.45□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 J3QT63 122 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 TGFAP01135 160 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 GRPP07492 148 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CD37P11049 281 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 TNFRSF1AP19438 455 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CFPP27918 469 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 MAB21L1Q13394 359 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 IDNKQ5T6J7 187 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 HES5Q5TA89 166 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 WDR86Q86TI4 376 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 NR2C2APQ86WQ0 139 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 LYPD6Q86Y78 171 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 MRI1Q9BV20 369 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 PKIBQ9C010 78 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 RAB1BQ9H0U4 201 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 DECR2Q9NUI1 292 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 A6NLC8 198 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 PLATP00750 562 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 UBBP0CG47 229 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 TMEM225BP0DP42 221 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 PTGFRP43088 359 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 OR3A4PP47883 348 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 ZNF154Q13106 437 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CNPY1Q3B7I2 92 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 AWAT2Q6E213 333 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 MKXQ8IYA7 352 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 SAXO1Q8IYX7 474 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 ZNF671Q8TAW3 534 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 ITLN1Q8WWA0 313 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 ERGIC1Q969X5 290 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 OR51I2Q9H344 312 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CNTD2Q9H8S5 307 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 FN3KRPQ9HA64 309 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 SAP30LQ9HAJ7 183 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa13.43□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 MPZP25189 248 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 GATA4P43694 442 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 ZP1P60852 638 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CCL8P80075 99 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 IL24Q13007 206 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 PDZK1IP1Q13113 114 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CR1LQ2VPA4 569 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 FAM76BQ5HYJ3 339 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 SLC25A26Q70HW3 274 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 RNF144BQ7Z419 303 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 ANGPTL5Q86XS5 388 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 CALHM1Q8IU99 346 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 SCCPDHQ8NBX0 429 aa13.42□□□□□ -0.26
IFT20-201ENST00000322326 OR4D6Q8NGJ1 314 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms