RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 F5P12259 2224 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 COX5BP10606 129 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF43P17038 809 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 HOXC8P31273 242 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 P2RY2P41231 377 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR3A4PP47883 348 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 GPM6BQ13491 265 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PRR18Q8N4B5 295 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C9J4A7 227 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 EREGO14944 169 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 LCATP04180 440 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PMCHP20382 165 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 APLNRP35414 380 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 GABRA4P48169 554 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 RUNX1Q01196 453 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR5R1Q8NH85 324 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 S1PR5Q9H228 398 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 DLEU1O43261 78 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CST6Q15828 149 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 BATF2Q8N1L9 274 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 BET1LQ9NYM9 111 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 RNF212BA8MTL3 300 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CLDN1O95832 211 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CXCL1P09341 107 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CTLA4P16410 223 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 VIPR2P41587 438 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PMP22Q01453 160 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 BAXQ07812 192 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR51H1Q8NH63 302 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 NAA60Q9H7X0 242 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MARCH11A6NNE9 402 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 HSD17B6O14756 317 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 IAPPP10997 89 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MUCL1Q96DR8 90 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 BMFQ96LC9 184 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ANK1P16157 1881 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 BCKDHBP21953 392 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 DYNLT3P51808 116 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 FZD5Q13467 585 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 GRINAQ7Z429 371 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 POC1AQ8NBT0 407 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MED29Q9NX70 200 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PARP14Q460N5 1801 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 SERPINE3A8MV23 424 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CDC14BO60729 498 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 NKX2-2O95096 273 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 LYRM4Q9HD34 91 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 NAT8Q9UHE5 227 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 LNP1A1A4G5 178 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 HSPB6O14558 160 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ATP5SQ99766 215 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 GCM1Q9NP62 436 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 RNF150Q9ULK6 438 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 PCNTO95613 3336 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 NGFRP08138 427 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 CT62P0C5K7 136 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 FUT3P21217 361 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 GABREP78334 506 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 C1QL4Q86Z23 238 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.72□□□□□ -0.05
PACS1-201ENST00000320580 SHDQ96IW2 340 aa14.72□□□□□ -0.05
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