RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 B3galnt1Q920V1 331 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CtsjQ9R014 334 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Esp8F7AMQ8 149 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prkar2aP12367 401 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ltc4sQ60860 150 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MffQ6PCP5 291 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tas2r116Q7M713 305 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prss54Q7M756 383 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1014Q7TR95 305 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1013Q7TR96 305 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam212bQ80VY2 300 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atg4dQ8BGV9 474 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sla2Q8R4L0 259 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr156Q8VGA9 318 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Syt17Q920M7 470 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ndufb10Q9DCS9 176 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sdf2Q9DCT5 211 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp53Q9Z117 652 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Igkv10-95A0A0G2JFY3 115 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arl16B1ATY8 173 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r67G5E8C1 305 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r57K7N731 310 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptpn6P29351 595 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ptx3P48759 381 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wfdc5Q4KXB6 126 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 BocQ6AZB0 1110 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ceacam14Q78Y72 263 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pcyt1bQ811Q9 369 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SlirpQ9D8T7 112 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 AicdaQ9WVE0 198 aa15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NacaP70670 2187 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gpr179E9PY61 2293 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnf148G3X9R7 316 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ppt2O35448 302 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dll3O88516 592 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PlauP06869 433 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RrasP10833 218 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gabra2P26048 451 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RbpjP31266 526 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gpr143P70259 405 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem18Q3TUD9 140 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PiglQ5SX19 252 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MaoaQ64133 526 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrp12Q8BUJ9 858 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc25a45Q8CFJ7 288 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Creb5Q8K1L0 357 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nsun5Q8K4F6 465 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Elf5Q8VDK3 253 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc115Q8VE99 180 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mfsd4b2Q9D8I5 366 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm10112D3YWP5 117 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp961E9Q4R5 444 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Itln1O88310 313 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Snai2P97469 269 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tob1Q61471 362 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Abhd17aQ99JW1 310 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc74aE9Q9U8 364 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 EndogO08600 294 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bcl2P10417 236 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Csrp3P50462 194 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gls2Q571F8 602 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CfiQ61129 603 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tex261Q62302 196 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 St8sia3Q64689 380 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dusp28Q8BTR5 163 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc25a1Q8JZU2 311 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Acer1Q8R4X1 273 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem267Q8VDR5 215 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmbim7Q9D592 302 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CN725425A0A087WRU1 652 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RelP15307 587 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nme1P15532 152 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cox5bP19536 128 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 B4galnt1Q09200 533 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lysmd4Q8CC84 293 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Scgb2b27Q8R1E9 112 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Taf9Q8VI33 264 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfand2bQ91X58 257 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q9CQT9 129 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gng13Q9JMF3 67 aa15.22■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr721-ps1A0A140T8T9 324 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fcn2O70497 314 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01881 257 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01882 290 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 EbpP70245 230 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tbrg1Q3UB74 406 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bahd1Q497V6 772 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr332Q5NC45 344 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NppcQ61839 126 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tle4Q62441 773 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr967Q7TRA6 310 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Crb2Q80YA8 1282 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Aph1aQ8BVF7 265 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp459Q8BZ17 267 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 FkrpQ8CG64 494 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ucn3Q924A4 164 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Skint9A7TZG3 319 aa15.21■□□□□ 0.03
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hoxc4Q08624 264 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.3 ms