RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MbpP04370 250 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lad1P57016 528 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nanos2P60322 136 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Folr2Q05685 251 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il10rbQ61190 349 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ranbp3lQ6PDH4 491 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdyhv1Q80WB5 209 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pskh1Q91YA2 424 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r171Q9EPS6 316 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GltpQ9JL62 209 aa26.14■■□□□ 1.78
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrrc29A0A1B0GQY9 621 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hoxb6P09023 224 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rab17P35292 214 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pax8Q00288 457 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mccc2Q3ULD5 563 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam169aQ5XG69 665 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zer1Q80ZJ6 779 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Srrm4Q8BKA3 608 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gper1Q8BMP4 375 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Las2Q8CB14 526 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kctd20Q8CDD8 419 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PiguQ8K358 434 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1240Q8VG73 314 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Loxl3Q9Z175 754 aa26.14■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm8127E9Q0P0 100 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm8024L7N2E0 100 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm17174M0QWQ9 212 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GastP48757 101 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spata46Q4FZF2 204 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Coq8bQ566J8 533 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nxph2Q61199 261 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 St6gal2Q76K27 524 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttc4Q8R3H9 386 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q9CRW3 126 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CmipQ9D486 773 aa26.13■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm15128A2ADW8 449 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm15093A2BI72 449 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Luzp4B1AV09 449 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm15127B1AVZ5 449 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm15107B1B0X0 449 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm15097E9QA14 449 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chst3O88199 472 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P01723 117 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 M6prP24668 278 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HfeP70387 359 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm15085Q62012 449 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AgerQ62151 402 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tle4Q62441 773 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr94Q6UAH0 386 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr198Q7TS40 306 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Orai1Q8BWG9 304 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mfsd4b1Q8VCV9 425 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem179bQ9CY24 219 aa26.12■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fbxw28E9Q8A4 466 aa26.11■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem14aP56983 99 aa26.11■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdk5r1P61809 307 aa26.11■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc6a7Q6PGE7 637 aa26.11■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf250Q7TNU6 535 aa26.11■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PirtQ8BFY0 135 aa26.11■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc30a8Q8BGG0 367 aa26.11■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Syngr4Q9Z1L2 233 aa26.11■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gcn1E9PVA8 2671 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 UcnP81615 122 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc38a1Q8K2P7 485 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pafah2Q8VDG7 390 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ndufa13Q9ERS2 144 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fzr1Q9R1K5 493 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv5-4A0A075B5P9 117 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r7E9Q8T0 311 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PitpnaP53810 271 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rce1P57791 329 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rac2Q05144 192 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr125Q14AJ9 320 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ceacam19Q3TQ88 271 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Alkal2Q80UG6 151 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GabrpQ8QZW7 440 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc25a42Q8R0Y8 318 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il24Q925S4 181 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pex14Q9R0A0 376 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc7a11Q9WTR6 502 aa26.1■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cyp4a30bA0A087WS15 508 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Galr2O88854 371 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm2aQ60648 193 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prima1Q810F0 153 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klhl42Q8BFQ9 493 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lhfpl2Q8BGA2 222 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MavsQ8VCF0 503 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1138Q8VFQ9 311 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sfxn5Q925N0 342 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Jam3Q9D8B7 310 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TslpQ9JIE6 140 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Crim1Q9JLL0 1037 aa26.09■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm13762A2ATG2 311 aa26.08■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc9bA3KGF9 545 aa26.08■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 UbcP0CG50 734 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc12a3P59158 1002 aa26.08■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ascl1Q02067 231 aa26.08■■□□□ 1.77
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm12253Q5NC48 229 aa26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms