Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Hoxb6P09023 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Hoxb6P09023 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Hoxb6P09023 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Hoxb6P09023 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
Hoxb6P09023 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Hoxb6P09023 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Hoxb6P09023 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Hoxb6P09023 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Hoxb6P09023 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Hoxb6P09023 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Hoxb6P09023 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Hoxb6P09023 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Hoxb6P09023 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Hoxb6P09023 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Hoxb6P09023 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Hoxb6P09023 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Hoxb6P09023 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Hoxb6P09023 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Hoxb6P09023 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Hoxb6P09023 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Hoxb6P09023 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxb6P09023 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Hoxb6P09023 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Hoxb6P09023 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Hoxb6P09023 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Hoxb6P09023 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Hoxb6P09023 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Hoxb6P09023 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
Hoxb6P09023 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Hoxb6P09023 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Hoxb6P09023 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Hoxb6P09023 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Hoxb6P09023 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Hoxb6P09023 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Hoxb6P09023 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Hoxb6P09023 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Hoxb6P09023 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Hoxb6P09023 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Hoxb6P09023 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Hoxb6P09023 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Hoxb6P09023 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Hoxb6P09023 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Hoxb6P09023 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Hoxb6P09023 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Hoxb6P09023 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Hoxb6P09023 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Hoxb6P09023 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Hoxb6P09023 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Hoxb6P09023 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Hoxb6P09023 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Hoxb6P09023 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Hoxb6P09023 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Hoxb6P09023 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Hoxb6P09023 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Hoxb6P09023 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Hoxb6P09023 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Hoxb6P09023 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Hoxb6P09023 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxb6P09023 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Hoxb6P09023 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Hoxb6P09023 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Hoxb6P09023 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Hoxb6P09023 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Hoxb6P09023 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Hoxb6P09023 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Hoxb6P09023 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Hoxb6P09023 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Hoxb6P09023 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Hoxb6P09023 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Hoxb6P09023 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Hoxb6P09023 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Hoxb6P09023 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Hoxb6P09023 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Hoxb6P09023 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Hoxb6P09023 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Hoxb6P09023 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Hoxb6P09023 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Hoxb6P09023 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1,59
Hoxb6P09023 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Hoxb6P09023 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Hoxb6P09023 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Hoxb6P09023 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Hoxb6P09023 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Hoxb6P09023 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Hoxb6P09023 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Hoxb6P09023 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Hoxb6P09023 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Hoxb6P09023 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Hoxb6P09023 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Hoxb6P09023 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Hoxb6P09023 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Hoxb6P09023 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Hoxb6P09023 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Hoxb6P09023 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Hoxb6P09023 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Hoxb6P09023 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Hoxb6P09023 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Hoxb6P09023 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Hoxb6P09023 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms