RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FGGYQ96C11 551 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 CYSLTR2Q9NS75 346 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 RABL2BQ9UNT1 228 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 DHRS3O75911 302 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A1P11166 492 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SGMS2Q8NHU3 365 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ORAI1Q96D31 301 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB10Q9UN67 800 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 J3QW42 95 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TPPPO94811 219 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 APOA1P02647 267 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDOBP05062 364 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINA5P05154 406 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 NAT2P11245 290 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHA1P21709 976 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 LYPD6Q86Y78 171 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf56Q8N813 242 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1J2Q8NGS2 313 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51F2Q8NH61 342 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 PP6455Q8WZ26 134 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A6Q92536 515 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SPSB4Q96A44 273 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC32Q9BV29 185 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM138Q9NPI0 162 aa20.37■□□□□ 0.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 WNK2Q9Y3S1 2297 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC105371242A0A075B767 164 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 FABP12A6NFH5 140 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC17A2O00624 439 aa20.36■□□□□ 0.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 LCATP04180 440 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf100Q5SVJ3 147 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf87Q6PH81 154 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 UTS2BQ765I0 119 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT74Q7RTS7 529 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 ESM1Q9NQ30 184 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R4Q9NYW5 299 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 V9GYH0 126 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TGP01266 2768 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC100509620A0A075B734 347 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV20A0A0B4J274 112 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 J3QRK9 145 aa20.35■□□□□ 0.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 STOMP27105 288 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 FAHD2AQ96GK7 314 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ICMTO60725 284 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB3AP20336 220 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 BDKRB2P30411 391 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF181Q2M3W8 571 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB37Q5TC79 503 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 UQCC2Q9BRT2 126 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ISPDA4D126 451 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 VGLL3A8MV65 326 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX1O43435 398 aa20.34■□□□□ 0.85
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CAPNS1-216ENST00000628306 COMMD2Q86X83 199 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC22Q8N966 263 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6M1Q8NGM8 313 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCG5Q9H222 651 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 OPA3Q9H6K4 179 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM77I1YAP6 450 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ELK1P19419 428 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 APLNRP35414 380 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TALDO1P37837 337 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GNALP38405 381 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP2K3P46734 347 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS23P62266 143 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SCGB2A2Q13296 93 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 AWAT1Q58HT5 328 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CNIH2Q6PI25 160 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QL2Q7Z5L3 287 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMD12Q8N8I0 201 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB40AQ8WXH6 277 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 REEP6Q96HR9 211 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF665Q9H7R5 613 aa20.33■□□□□ 0.84
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