RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-209	ENST00000587215	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	SAA4	P35542	130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	OCLN	Q16625	522 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215		Q6ZSR3	168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	POC1A	Q8NBT0	407 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	AJUBA	Q96IF1	538 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	MNT	Q99583	582 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	GPR173	Q9NS66	373 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	DLGAP1	O14490	977 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	PRDX2	P32119	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	HAAO	P46952	286 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	ACTR3	P61158	418 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	EGR3	Q06889	387 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	ACSM1	Q08AH1	577 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	BLMH	Q13867	455 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	SSX6	Q7RTT6	188 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215		H0YAE9	185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	TSPAN9	O75954	239 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	FAS	P25445	335 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	DEFA6	Q01524	100 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215		J3QT63	122 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	PAH	P00439	452 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	TGFBR2	P37173	567 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	CAPZA1	P52907	286 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	ASRGL1	Q7L266	308 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF561	Q8N587	486 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	HES4	Q9HCC6	221 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	TIMM23	O14925	209 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	CCL1	P22362	96 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	MPZ	P25189	248 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	ERVK11-1	P61568	191 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	MIDN	Q504T8	468 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	GID4	Q8IVV7	300 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	RORB	Q92753	470 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	TBX5	Q99593	518 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	CIB1	Q99828	191 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	VWF	P04275	2813 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215		M0QZ24	198 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKN1-209	ENST00000587215	PAX6	P26367	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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