RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	PET100	P0DJ07	73 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	FCGR2A	P12318	317 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ABO	P16442	354 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	FPR2	P25090	351 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR3A3	P47888	321 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR3A2	P47893	321 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	IL13RA1	P78552	427 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ARFRP1	Q13795	201 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR8B8	Q15620	311 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ST8SIA4	Q92187	359 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO17	Q96EF6	278 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC6A7	Q99884	636 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	NMES1	Q9C002	83 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	SDK2	Q58EX2	2172 aa		10.3	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442		G3V3Q6	166 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	CXCL13	O43927	109 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	NEURL1	O76050	574 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OPN1LW	P04000	364 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	GLA	P06280	429 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	RNF224	P0DH78	156 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	MGMT	P16455	207 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF708	P17019	499 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	TUBG1	P23258	451 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	CLDN15	P56746	228 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	MALL	Q13021	153 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442		Q8NFD4	153 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	REEP6	Q96HR9	211 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	PLK3	Q9H4B4	646 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	DECR2	Q9NUI1	292 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	MEMO1	Q9Y316	297 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF175	Q9Y473	711 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR5H14	A6NHG9	310 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	AGRP	O00253	132 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	GOSR2	O14653	212 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	NME2P1	O60361	137 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	LCAT	P04180	440 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	SP1	P08047	785 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	PTHLH	P12272	177 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	GNB3	P16520	340 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	M6PR	P20645	277 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	NME2	P22392	152 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	HRH1	P35367	487 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	LHX2	P50458	406 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	MTCP1	P56278	107 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM50B	P56557	158 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	BAMBI	Q13145	260 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	OR1C1	Q15619	314 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LETMD1-223	ENST00000550442	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.28	□□□□□ -0.76

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