RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PP6455Q8WZ26 134 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TECTBQ96PL2 329 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5M11Q96RB7 305 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MICU1Q9BPX6 476 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MRI1Q9BV20 369 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CHST5Q9GZS9 411 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MMP26Q9NRE1 261 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5B21A6NL26 309 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ALX3O95076 343 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 FSTL3O95633 263 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 SERPINA3P01011 423 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CRYBA1P05813 215 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CFHR2P36980 270 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 GNG3P63215 75 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF154Q13106 437 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 DOC2BQ14184 412 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 UTS2BQ765I0 119 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 SVOPQ8N4V2 548 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR148Q8TDV2 347 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 GHSRQ92847 366 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 RNF170Q96K19 258 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 LRRC30A6NM36 301 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM178BH3BS89 294 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 M0QZ24 198 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TNFAIP8O95379 198 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CD2P06729 351 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF20P17024 532 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CELP19835 753 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PMELP40967 661 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TPBGQ13641 420 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MED22Q15528 200 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MPPED2Q15777 294 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 UBE2V2Q15819 145 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 CEP78Q5JTW2 689 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF773Q6PK81 442 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MOB3CQ70IA8 216 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 WDR86Q86TI4 376 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 THRSPQ92748 146 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 FGGYQ96C11 551 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 MMP27Q9H306 513 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR173Q9NS66 373 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 DHDHQ9UQ10 334 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 NPTNQ9Y639 398 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 A6NIN4 97 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 A6NLC8 198 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF732B4DXR9 585 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms