RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	TFDP2	Q14188	446 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	ELOC	Q15369	112 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	CST6	Q15828	149 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	MAJIN	Q3KP22	176 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	DEFB119	Q8N690	84 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	BLNK	Q8WV28	456 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	TNFRSF14	Q92956	283 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	OTOF	Q9HC10	1997 aa		0.43	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	LY6L	H3BQJ8	138 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	OR2F2	O95006	317 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	CTLA4	P16410	223 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	CRABP2	P29373	138 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	UQCRFS1	P47985	274 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	NUDT2	P50583	147 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	UNC93A	Q86WB7	457 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	OR52E5	Q8NH55	327 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	C8orf44	Q96CB5	159 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760		Q96MT0	163 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	PKIB	Q9C010	78 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	VAX2	Q9UIW0	290 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	JCAD	Q9P266	1359 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		0.42	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	CACNA1S	Q13698	1873 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760		K7ERS5	55 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	BCKDK	O14874	412 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	ZBTB5	O15062	677 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	HLA-G	P17693	338 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	SLC18A1	P54219	525 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	ITIH4	Q14624	930 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	NRGN	Q92686	78 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	PRORY	Q9H606	182 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	REEP1	Q9H902	201 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		0.41	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760	RGS12	O14924	1447 aa		0.4	□□□□□ -2.34
CDK1-208	ENST00000519760		A0A0B4J2E0	115 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	GMNC	A6NCL1	334 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760		H3BRN7	92 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TEX46	H3BTG2	121 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	OPN1SW	P03999	348 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	OR4Q2	P0C623	313 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	GABRA6	Q16445	453 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF563	Q8TA94	476 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	PANX1	Q96RD7	426 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ARV1	Q9H2C2	271 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760		A6NED7	52 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	LEUTX	A8MZ59	168 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760		C9JQL5	133 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760		F5H5P2	479 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760		H0Y8G0	127 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760		K7EPK0	472 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	RGS5	O15539	181 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	PTTG1	O95997	202 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	IFNW1	P05000	195 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	STOM	P27105	288 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SULT1E1	P49888	294 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	MTPN	P58546	118 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TRDN	Q13061	729 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		0.39	□□□□□ -2.35

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