RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF91	Q05481	1191 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	BAMBI	Q13145	260 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	IKZF1	Q13422	519 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	DGUOK	Q16854	277 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	FDX2	Q6P4F2	183 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	STMN2	Q93045	179 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SDSL	Q96GA7	329 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327		Q96MT0	163 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	PKIB	Q9C010	78 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	DAPL1	A0PJW8	107 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SYNGR1	O43759	233 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	IGHA1	P01876	353 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ISG15	P05161	165 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ARF6	P62330	175 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ODF4	Q2M2E3	257 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	PP6455	Q8WZ26	134 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ADI1	Q9BV57	179 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327		A6NIN4	97 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV1-69	P01742	117 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	TFF1	P04155	84 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	GABRA2	P47869	451 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	CCR9	P51686	369 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	OR12D2	P58182	307 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	IL24	Q13007	206 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	UBE2V2	Q15819	145 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	CALHM1	Q8IU99	346 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SYS1	Q8N2H4	156 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	LHX4	Q969G2	390 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A28	Q96A46	364 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	NOX4	Q9NPH5	578 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327		M0R1W7	72 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	NXPH2	O95156	264 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	BAG2	O95816	211 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	SERPINA3	P01011	423 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	HTR1A	P08908	422 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	HKR1	P10072	659 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	FUT6	P51993	359 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	RAB40B	Q12829	278 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	GALE	Q14376	348 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	UTS2B	Q765I0	119 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF561	Q8N587	486 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	APH1B	Q8WW43	257 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	PELI1	Q96FA3	418 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	C4orf36	Q96KX1	117 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF488	Q96MN9	340 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	ALG8	Q9BVK2	526 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	C8orf4	Q9NR00	106 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RBM28-208	ENST00000495327		H3BSH0	61 aa		10.96	□□□□□ -0.65

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