RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA3P01011 423 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 TFF1P04155 84 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 EPHA1P21709 976 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 MPZP25189 248 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ANGPTL5Q86XS5 388 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 PP6455Q8WZ26 134 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 TMIGD2Q96BF3 282 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 RASL12Q9NYN1 266 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 MXRA5Q9NR99 2828 aa17.37■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 OR2AT4A6NND4 320 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 H0YJX3 145 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ENSAO43768 121 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ZFPL1O95159 310 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 PGA5P0DJD9 388 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 PPIAL4GP0DN37 164 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 SELLP14151 372 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 FUT6P51993 359 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 OR2G6Q5TZ20 316 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ACP7Q6ZNF0 438 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 UTS2BQ765I0 119 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 BTN2A1Q7KYR7 527 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 TMEM80Q96HE8 168 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 GAFA1Q96PS6 74 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 PKIBQ9C010 78 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 CLEC2DQ9UHP7 191 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ZNF222Q9UK12 451 aa17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 XPNPEP2O43895 674 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 CCDC159P0C7I6 412 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 PSG2P11465 335 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 PIPP12273 146 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 AQP4P55087 323 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 IL24Q13007 206 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 IKZF1Q13422 519 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 C11orf91Q3C1V1 193 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 XAF1Q6GPH4 301 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 OR5AK2Q8NH90 309 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ST8SIA4Q92187 359 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 BORCS8Q96FH0 119 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 NRIP2Q9BQI9 281 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 OCEL1Q9H607 264 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 TMEM212A6NML5 194 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC5O15389 551 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 NDUFB3O43676 98 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ECDO95905 644 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ZNF20P17024 532 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ATF1P18846 271 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ERVK11-1P61568 191 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ST3GAL4Q11206 333 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 SCGB2A2Q13296 93 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 DGUOKQ16854 277 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 ARMCX4Q5H9R4 360 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 DNAAF1Q8NEP3 725 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 OR13C3Q8NGS6 347 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 RPS4Y2Q8TD47 263 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 UPRTQ96BW1 309 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 MED30Q96HR3 178 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTB-211ENST00000480301 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB10A6NFE3 127 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 NKX6-3A6NJ46 265 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 TCF21O43680 179 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 LIPFP07098 398 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RPSAP08865 295 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 MYL12AP19105 171 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 FGF12P61328 243 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 IL13RA1P78552 427 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 CDK5R1Q15078 307 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 CCDC58Q4VC31 144 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 LRRC10Q5BKY1 277 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 BATF2Q8N1L9 274 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 COMMD4Q9H0A8 199 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 HES4Q9HCC6 221 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 BABAM2Q9NXR7 383 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 MTCH1Q9NZJ7 389 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 NUP50Q9UKX7 468 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 MAB21L2Q9Y586 359 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ZNF879B4DU55 563 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 GPR37O15354 613 aa17.32■□□□□ 0.36
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