RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 NELFAQ9H3P2 528 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 DSN1Q9H410 356 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 RASL12Q9NYN1 266 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 FBXL17Q9UF56 701 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 KPTNQ9Y664 436 aa6.4□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 MED12LQ86YW9 2145 aa6.4□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 B4DXG7 233 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 F6UZH7 168 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SIVA1O15304 175 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 NKX2-2O95096 273 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TSPAN13O95857 204 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 THY1P04216 161 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ACP2P11117 423 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB6AP20340 208 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MALP21145 153 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ACVR1BP36896 505 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 HBA1P69905 142 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MS4A2Q01362 244 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DEFA5Q01523 94 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PYY3Q5JQD4 70 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 UQCC3Q6UW78 93 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 LGI3Q8N145 548 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MARK4Q96L34 752 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF583Q96ND8 569 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DOHHQ9BU89 302 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DPY30Q9C005 99 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 CHST5Q9GZS9 411 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.39□□□□□ -1.39
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RPUSD3-212ENST00000466141 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.39□□□□□ -1.39
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RPUSD3-212ENST00000466141 A0A0G2JND7 137 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PPR1 153 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM218A2RU14 115 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SMCO3A2RU48 225 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 HSPB2A8KAH6 182 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF212BA8MTL3 300 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ST8SIA3O43173 380 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 CA11O75493 328 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 UPK3AO75631 287 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ABHD16AO95870 558 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 TXNDC12O95881 172 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 IGKV1D-16P01601 117 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 IGHG3P01860 377 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 C1QCP02747 245 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 ARG1P05089 322 aa6.38□□□□□ -1.39
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RPUSD3-212ENST00000466141 HOXA5P20719 270 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC6A2P23975 617 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 MAGEA5P43359 124 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 GAS1P54826 345 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 PRR5P85299 388 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 NAAAQ02083 359 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 UBE2V1Q13404 147 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 HSPB2Q16082 182 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 DUSP5Q16690 384 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 FBLN7Q53RD9 439 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.38□□□□□ -1.39
RPUSD3-212ENST00000466141 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.38□□□□□ -1.39
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