RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466076.1

BCR-208, Transcript of BCR, RhoGEF and GTPase activating protein, human

TSL 3

Gene BCR, Length 495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCR-208	ENST00000466076	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CDC14B	O60729	498 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CDRT1	O95170	752 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CFP	P27918	469 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	PTGFR	P43088	359 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	PDLIM4	P50479	330 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	BMX	P51813	675 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	TMEM33	P57088	247 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	ZP1	P60852	638 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	NCS1	P62166	190 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	LYPD6	Q86Y78	171 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	RFT1	Q96AA3	541 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	NDUFS8	O00217	210 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SLC17A2	O00624	439 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SSX4	O60224	188 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	NDUFS7	O75251	213 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	RP2	O75695	350 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	FSTL3	O95633	263 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	UBB	P0CG47	229 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	COL8A2	P25067	703 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	PMEL	P40967	661 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SERPINB10	P48595	397 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	VBP1	P61758	197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	GPR176	Q14439	515 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	POC1A	Q8NBT0	407 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	OR51F2	Q8NH61	342 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CEP19	Q96LK0	163 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	IFITM5	A6NNB3	132 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	AIP	O00170	330 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SYNGR1	O43759	233 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	RHBDL1	O75783	438 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	KDM4B	O94953	1096 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	PLAT	P00750	562 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	LHB	P01229	141 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	HTR2C	P28335	458 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	OR3A4P	P47883	348 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	RSU1	Q15404	277 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	RAB11B	Q15907	218 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	AWAT2	Q6E213	333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	GFI1	Q99684	422 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	LY6H	O94772	140 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	GLRA1	P23415	457 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	GIF	P27352	417 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	MXD1	Q05195	221 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	KCNJ8	Q15842	424 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BCR-208	ENST00000466076	RAB1C	Q92928	201 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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