RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	MTOR	P42345	2549 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731		A0A1B0GVI7	797 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	CCRL2	O00421	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	RP2	O75695	350 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	LHB	P01229	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	MPZ	P25189	248 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	GIF	P27352	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TGFBR2	P37173	567 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF81	P51508	661 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	EFNA4	P52798	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	UFD1	Q92890	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	FGGY	Q96C11	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	DERL3	Q96Q80	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	OR51I2	Q9H344	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65	2e-12	■■■□□ 15.5
PTPN12-209	ENST00000460731	ABCA1	O95477	2261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	DYSF	O75923	2080 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731		A0A1W2PRX2	142 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM210	A6NLX4	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731		H0YL77	283 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	LMX1B	O60663	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	SERPINA3	P01011	423 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	NRAS	P01111	189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ATF1	P18846	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	SRM	P19623	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	PRKACB	P22694	351 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	CA6	P23280	308 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	PMEL	P40967	661 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	MAGEB1	P43366	347 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	FUT6	P51993	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM33	P57088	247 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	GNG3	P63215	75 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	FABP5	Q01469	135 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	PRDX4	Q13162	271 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	NRGN	Q92686	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PTPN12-209	ENST00000460731	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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