RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CREG2Q8IUH2 290 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INIPQ9NRY2 104 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGHV3-11P01762 117 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOX6P35712 828 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q8N6K4 173 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR2T11Q8NH01 316 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PNPOQ9NVS9 261 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 K7N7A8 449 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MMP23AO75900 390 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MT1HL1P0DM35 61 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AQP1P29972 269 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYNJ2BPP57105 145 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HIST1H3AP68431 136 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MROH9Q5TGP6 573 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAA40Q86UY6 237 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOMM40LQ969M1 308 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHOVQ96L33 236 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SP140LQ9H930 580 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFT52Q9Y366 437 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB4AO15263 64 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEFHP12036 1026 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAC1P20366 129 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASQ1P31415 396 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC6A6P31641 620 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR52W1Q6IF63 320 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPEQ96AT9 228 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CALML5Q9NZT1 146 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LPAP08519 4548 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR5F1O95221 314 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDOSTP39656 456 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SERPINB8P50452 374 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNG11P61952 73 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP1R7Q15435 360 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LNX2Q8N448 690 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0B4J203 849 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM210A6NLX4 147 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAGEB3O15480 346 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFNA5P01569 189 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 P0C879 139 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRDX2P32119 198 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDH12P55289 794 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR11H2Q8NH07 326 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR8B4Q96RC9 309 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 S1PR3Q99500 378 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 F5H5K5 113 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H3BQF6 201 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms