RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 NLKQ9UBE8 527 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 DUX4Q9UBX2 424 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 AUP1Q9Y679 476 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 TMEM212A6NML5 194 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 C22orf46C9J442 243 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 DVL1O14640 695 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 AMY2BP19961 511 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 FUT6P51993 359 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 CALHM1Q8IU99 346 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 POC1AQ8NBT0 407 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 NANPQ8TBE9 248 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 BORCS8Q96FH0 119 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ZNF488Q96MN9 340 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 METRNQ9UJH8 293 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 OR2AT4A6NND4 320 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 FCN3O75636 299 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 TFF1P04155 84 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 PGA5P0DJD9 388 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ATF1P18846 271 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 MPZP25189 248 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 PAX8Q06710 450 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 CD276Q5ZPR3 534 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 XAF1Q6GPH4 301 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 AHSA2Q719I0 299 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 UTS2BQ765I0 119 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 STX19Q8N4C7 294 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ST8SIA4Q92187 359 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 PKIBQ9C010 78 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 RASL12Q9NYN1 266 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ATP6V1G2O95670 118 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 GABRA2P47869 451 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 IL24Q13007 206 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 IKZF1Q13422 519 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 CDK5R1Q15078 307 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 CCDC58Q4VC31 144 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 BATF2Q8N1L9 274 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 FGFRL1Q8N441 504 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 OR52N1Q8NH53 320 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 GAFA1Q96PS6 74 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 DHDHQ9UQ10 334 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-205ENST00000426683 NDUFB3O43676 98 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 LALBAP00709 142 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 PLATP00750 562 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 OCM2P0CE71 109 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 PSG2P11465 335 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 SELLP14151 372 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 PRKACBP22694 351 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 RBP2P50120 134 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 ATP1B3P54709 279 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 RIPK1Q13546 671 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 JMJD1CQ15652 2540 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 NXPH2O95156 264 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 FSHBP01225 129 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 EPHA1P21709 976 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 MTCP1P56278 107 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 IL13RA1P78552 427 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 SCGB2A2Q13296 93 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 DGUOKQ16854 277 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-205ENST00000426683 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms