RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SULT1B1O43704 296 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EGR1P18146 543 aa12.78□□□□□ -0.36
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX29Q8N6K0 151 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM106AQ96A25 262 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OPALINQ96PE5 141 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ISYNA1Q9NPH2 558 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJB11Q9UBS4 358 aa12.78□□□□□ -0.36
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LPAR3Q9UBY5 353 aa12.78□□□□□ -0.36
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHBDL1O75783 438 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYB5AP00167 134 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PGA5P0DJD9 388 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLRA1P23415 457 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBMXP38159 391 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MED22Q15528 200 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q499Y3 187 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DMRTC1Q5HYR2 192 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STUMQ69YW2 141 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF529Q6P280 563 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8IYB0 196 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MS4A15Q8N5U1 240 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR13C9Q8NGT0 318 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SGCDQ92629 289 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMIGD2Q96BF3 282 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRIP2Q9BQI9 281 aa12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC90BQ9GZT6 254 aa12.77□□□□□ -0.37
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLKQ9UBE8 527 aa12.77□□□□□ -0.37
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa12.77□□□□□ -0.37
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNF1AP20823 631 aa12.76□□□□□ -0.37
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOX2P48431 317 aa12.76□□□□□ -0.37
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM21Q3B7S5 101 aa12.76□□□□□ -0.37
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C19orf18Q8NEA5 215 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4M2Q8NGB6 313 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPRL2Q8WTW4 380 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5M11Q96RB7 305 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHOFQ9HBH0 211 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CKLFQ9UBR5 152 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLN8Q9UBY8 286 aa12.76□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NKX6-3A6NJ46 265 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAM20O43506 726 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNGR1O43759 233 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPX5O75715 221 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FSTP19883 344 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VAMP1P23763 118 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVK11-1P61568 191 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD276Q5ZPR3 534 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF841Q6ZN19 808 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANGPTL5Q86XS5 388 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAXO1Q8IYX7 474 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SVOPQ8N4V2 548 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFP41Q8N8Y5 198 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UFD1Q92890 307 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MED30Q96HR3 178 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEP19Q96LK0 163 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR13Q9H1Z4 485 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.75□□□□□ -0.37
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HES4Q9HCC6 221 aa12.75□□□□□ -0.37
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