RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RRADP55042 308 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MKXQ8IYA7 352 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ST8SIA1Q92185 356 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NMES1Q9C002 83 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MAGT1Q9H0U3 335 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TUBG2Q9NRH3 451 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 WASF3Q9UPY6 502 aa15.18■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CXCL13O43927 109 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MT-CO3P00414 261 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 C2orf68Q2NKX9 166 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DOCK9Q9BZ29 2069 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PR77 199 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ASCL1P50553 236 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 LCN15Q6UWW0 184 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RAB33BQ9H082 229 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SLC37A1P57057 533 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FAM209BQ5JX69 171 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 BATF2Q8N1L9 274 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CABLES2Q9BTV7 478 aa15.17■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MPTX1A8MV57 137 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MPGP29372 298 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 THEM4Q5T1C6 240 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SERPINE3A8MV23 424 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CRLF2Q9HC73 371 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 KIR3DL2P43630 455 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RAB4BP61018 213 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF813Q6ZN06 617 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 UBAC2Q8NBM4 344 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MENTQ9BUN1 341 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MFRPQ9BY79 579 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 C12orf49Q9H741 205 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 BCO1Q9HAY6 547 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SSSCA1O60232 199 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DFFBO76075 338 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GUSBP08236 651 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DEGS2Q6QHC5 323 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM104Q8NE00 496 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TAAR9Q96RI9 348 aa15.16■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PPP5D1E7EU14 171 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 UPK3AO75631 287 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OR2A2Q6IF42 318 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 KLK13Q9UKR3 277 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 POMT1Q9Y6A1 747 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ALG1L2C9J202 215 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NGFRP08138 427 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RAB5AP20339 215 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 EFNB1P98172 346 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SDSLQ96GA7 329 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PLK3Q9H4B4 646 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CDH20Q9HBT6 801 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FAHP16930 419 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CDAP32320 146 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 HBG1P69891 147 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 HBG2P69892 147 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FUT7Q11130 342 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CARFQ8N187 725 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SARGQ9BW04 601 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GHRLQ9UBU3 117 aa15.15■□□□□ 0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CST7O76096 145 aa15.14■□□□□ 0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TRPC1-201ENST00000273482 NAAAQ02083 359 aa15.14■□□□□ 0.01
TRPC1-201ENST00000273482 AADACL3Q5VUY0 350 aa15.14■□□□□ 0.01
TRPC1-201ENST00000273482 PTPRDP23468 1912 aa15.14■□□□□ 0.01
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF727A8MUV8 499 aa15.14■□□□□ 0.01
TRPC1-201ENST00000273482 MFNGO00587 321 aa15.14■□□□□ 0.01
TRPC1-201ENST00000273482 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms