RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZNF671Q8TAW3 534 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 FAHD2AQ96GK7 314 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ZNF488Q96MN9 340 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 OR8B2Q96RD0 313 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 SHARPINQ9H0F6 387 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 RASSF4Q9H2L5 321 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DUSP21Q9H596 190 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 SMURF1Q9HCE7 757 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 TRIM36Q9NQ86 728 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DUX4Q9UBX2 424 aa18.54■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PTGES3LE9PB15 166 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 J3QT63 122 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 GATBO75879 557 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PGA5P0DJD9 388 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ATF1P18846 271 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ8Q15842 424 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 STUMQ69YW2 141 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PRIMA1Q86XR5 153 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PARP16Q8N5Y8 322 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 POC1AQ8NBT0 407 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 OR13C3Q8NGS6 347 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 TECTBQ96PL2 329 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 BEX2Q9BXY8 128 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 SNTG1Q9NSN8 517 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 OPN4Q9UHM6 478 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 RAB26Q9ULW5 256 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A11Q9UPY5 501 aa18.53■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ADAM20O43506 726 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA3P01011 423 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 TFF1P04155 84 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ERVK11-1P61568 191 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 GNB2P62879 340 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 MED21Q13503 144 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 IRF3Q14653 427 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 FGFRL1Q8N441 504 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ZFP41Q8N8Y5 198 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 DNAAF1Q8NEP3 725 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 ANGPTL6Q8NI99 470 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 SMIM19Q96E16 107 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PGLYRP3Q96LB9 341 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CCL13Q99616 98 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 CDCA4Q9BXL8 241 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 PKIBQ9C010 78 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 COMMD4Q9H0A8 199 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 LPAR3Q9UBY5 353 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 INSIG2Q9Y5U4 225 aa18.52■□□□□ 0.56
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JMP0 313 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 A0A0X1KG70 313 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ZNF20P17024 532 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 GLRA1P23415 457 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 DCAF12L2Q5VW00 463 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 NLRC3Q7RTR2 1065 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 OR4M2Q8NGB6 313 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 NRIP2Q9BQI9 281 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 HES4Q9HCC6 221 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 MTCH1Q9NZJ7 389 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 NLKQ9UBE8 527 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 CLN8Q9UBY8 286 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ZNF222Q9UK12 451 aa18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 C22orf46C9J442 243 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ALX3O95076 343 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 MT-ND2P03891 347 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 RPSAP08865 295 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 PSG2P11465 335 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 PCMT1P22061 227 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 GATA3P23771 443 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 CRHBPP24387 322 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 WNT4P56705 351 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 IL24Q13007 206 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ZNF529Q6P280 563 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ACP7Q6ZNF0 438 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ZNF788Q6ZQV5 615 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 GHSRQ92847 366 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 CNBD2Q96M20 576 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SCN3BQ9NY72 215 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 RASL12Q9NYN1 266 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ZNF281Q9Y2X9 895 aa18.5■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 F8VVB4 439 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 F8VWA3 439 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 J3QLI3 93 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 DVL1O14640 695 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS2O15393 492 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 FAM157CP0CG43 387 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SELLP14151 372 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 NPY4RP50391 375 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 PAX8Q06710 450 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA12Q8IW75 414 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 FAM216BQ8N7L0 139 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 OR13C5Q8NGS8 318 aa18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.4 ms