RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 OR5B21A6NL26 309 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB5-211ENST00000608107 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
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ITGB5-211ENST00000608107 ARL6IP5O75915 188 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB5-211ENST00000608107 GABARAPO95166 117 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB5-211ENST00000608107 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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ITGB5-211ENST00000608107 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB5-211ENST00000608107 A0A0B4J203 849 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB5-211ENST00000608107 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.64□□□□□ -1.03
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ITGB5-211ENST00000608107 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB5-211ENST00000608107 F8VVB4 439 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB5-211ENST00000608107 F8VWA3 439 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB5-211ENST00000608107 J3QT63 122 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB5-211ENST00000608107 WNT9BO14905 357 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB5-211ENST00000608107 MAGEB3O15480 346 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB5-211ENST00000608107 AKR7A2O43488 359 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB5-211ENST00000608107 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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