RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598038.5

GTPBP3-216, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 5

Gene GTPBP3, Length 2,917 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-216	ENST00000598038	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SERPINA5	P05154	406 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	CARD18	P57730	90 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	GNG8	Q9UK08	70 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	BCL2L11	O43521	198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	HTR5A	P47898	357 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF85	Q03923	595 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	NEU1	Q99519	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038		A0A087X0M5	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038		A0A1B0GX30	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	PIN1P1	O15428	100 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF208	O43345	1280 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	MAS1	P04201	325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF43	P17038	809 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SLC2A5	P22732	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	RBP2	P50120	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	EFNB2	P52799	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	TAS2R20	P59543	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	MEF2D	Q14814	521 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	UEVLD	Q8IX04	471 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	HAS2	Q92819	552 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	GFRA1	P56159	465 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	IRGM	A1A4Y4	181 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPARC	P09486	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	RAC1	P63000	192 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	PXK	Q7Z7A4	578 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	HGFAC	Q04756	655 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	TRAM1	Q15629	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	ASB10	Q8WXI3	467 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	PLPP2	O43688	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SBK2	P0C263	348 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	RSU1	Q15404	277 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	C12orf49	Q9H741	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP3-216	ENST00000598038	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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