RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	HHAT	Q5VTY9	493 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608		Q6ZT83	130 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	WDR86	Q86TI4	376 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR8G5	Q8NG78	346 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	VAT1	Q99536	393 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NUDT9	Q9BW91	350 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TFR2	Q9UP52	801 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	BPY2	O14599	106 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TAAR5	O14804	337 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CTDNEP1	O95476	244 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MAG	P20916	626 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TRDN	Q13061	729 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CDNF	Q49AH0	187 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TTL	Q8NG68	377 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CTRC	Q99895	268 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MED10	Q9BTT4	135 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TMED9	Q9BVK6	235 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC42	Q9Y546	428 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SULT1C2	O00338	296 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SGCE	O43556	437 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV3-11	P01762	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	HLA-DQB1	P01920	261 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TEAD1	P28347	426 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	HTR2B	P41595	481 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	AQP5	P55064	265 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SKP1	P63208	163 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM25	Q86YD3	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IFT81	Q8WYA0	676 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	METTL26	Q96S19	204 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	RSG1	Q9BU20	258 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PRORY	Q9H606	182 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SNX24	Q9Y343	169 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PCM1	Q15154	2024 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CDIPT	O14735	213 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF688	P0C7X2	276 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	HLA-G	P17693	338 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ME2	P23368	584 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IL3RA	P26951	378 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PSMB5	P28074	263 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	DSTN	P60981	165 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TSPAN5	P62079	268 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PRKCD	Q05655	676 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	DMC1	Q14565	340 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TRAM1	Q15629	374 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZBTB6	Q15916	424 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608		Q6P435	159 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PRNT	Q86SH4	94 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.09	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms