RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 SPI1P17947 270 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PGCP20142 388 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 INPP1P49441 399 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF85Q03923 595 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PON3Q15166 354 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NSDHLQ15738 373 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CD226Q15762 336 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 VWA2Q5GFL6 755 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIQKQ629K1 86 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HBMQ6B0K9 141 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RHBDD2Q6NTF9 364 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LEG1Q6P5S2 330 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL9Q6T311 187 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAP14Q86UN6 197 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TPRA1Q86W33 373 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C9orf40Q8IXQ3 194 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR22Q8IZ63 422 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCA7Q8IZY2 2146 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SYS1Q8N2H4 156 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A45Q8N413 288 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF321PQ8N8H1 164 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PLPP5Q8NEB5 264 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C17orf47Q8NEP4 570 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2T27Q8NH04 317 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4K13Q8NH42 304 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LIPHQ8WWY8 451 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ADIPOR1Q96A54 375 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf48Q96LS8 159 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ATF6BQ99941 703 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT9Q9BW91 350 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NANSQ9NR45 359 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FZR1Q9UM11 496 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MOKQ9UQ07 419 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM208BQ5VWN6 2430 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP54Q96N23 3096 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR179Q6PRD1 2367 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GTQ1 180 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HELTA6NFD8 242 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF716A6NP11 495 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM25AB3EWG3 89 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM25CB3EWG5 89 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM25GB3EWG6 89 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRN3E7EW58 273 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf97H3BN30 126 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCD5O14737 125 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PHYHO14832 338 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SIGLEC5O15389 551 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRTM2O43300 516 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HPGDSO60760 199 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SCRG1O75711 98 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RHBDL1O75783 438 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GATBO75879 557 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL6IP5O75915 188 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT14O95848 222 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GYPBP06028 91 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DCNP07585 359 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CD14P08571 375 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ASAH2BP0C7U1 165 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF735P0CB33 412 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GSTT2P0CG29 244 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GSTT2BP0CG30 244 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKAR1AP10644 381 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF44P15621 663 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CXCR1P25024 350 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EDNRAP25101 427 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXA6P31267 233 aa3.53□□□□□ -1.84
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