RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	DHRS3	O75911	302 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	MT-ND4L	P03901	98 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	CTSB	P07858	339 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	RD3L	P0DJH9	198 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	SPINK2	P20155	84 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	NFYB	P25208	207 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193		Q7L0L9	218 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	HGD	Q93099	445 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	AMELY	Q99218	206 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	RAB9B	Q9NP90	201 aa		7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	PSMB3	P49720	205 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	MZT1	Q08AG7	82 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	SLC10A1	Q14973	349 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	MIDN	Q504T8	468 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	SPSB1	Q96BD6	273 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF727	A8MUV8	499 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	SPINT2	O43291	252 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	GPM6A	P51674	278 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	FUT6	P51993	359 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	LIMK1	P53667	647 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	DRAM2	Q6UX65	266 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	ASB10	Q8WXI3	467 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	RAB18	Q9NP72	206 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	LCT	P09848	1927 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	POLE	Q07864	2286 aa		7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
NEK1-208	ENST00000512193	GPR31	O00270	319 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ONECUT2	O95948	504 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	BGLAP	P02818	100 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GLA	P06280	429 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NGFR	P08138	427 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	KIR3DL2	P43630	455 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RRAD	P55042	308 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MGAT2	Q10469	447 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR8G1	Q15617	311 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TRIL	Q7L0X0	811 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF573	Q86YE8	665 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR8U1	Q8NH10	309 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR2M5	A3KFT3	312 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00862	A6NCI5	91 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193		H7BYZ3	331 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PIN1P1	O15428	100 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CST4	P01036	141 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV4-34	P06331	123 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CRH	P06850	196 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SFTA3	P0C7M3	94 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FABP6	P51161	128 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GUK1	Q16774	197 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RASL10B	Q96S79	203 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SARG	Q9BW04	601 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MED9	Q9NWA0	146 aa		7.15	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27

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