RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-214ENST00000490425 ZNF69Q9UC07 566 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-214ENST00000490425 NUP50Q9UKX7 468 aa9.97□□□□□ -0.81
NISCH-214ENST00000490425 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
NISCH-214ENST00000490425 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
NISCH-214ENST00000490425 SNTNA6NMZ2 147 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 J3QLW9 94 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ENSAO43768 121 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 CLIC3O95833 236 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ZNF19P17023 458 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 GLRA1P23415 457 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PEX2P28328 305 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 IKZF1Q13422 519 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 CD276Q5ZPR3 534 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 STUMQ69YW2 141 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 Q6ZSR3 168 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 APH1BQ8WW43 257 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 AQP3Q92482 292 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ZNF488Q96MN9 340 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 Q96MT0 163 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ADI1Q9BV57 179 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 SYNGR1O43759 233 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 MPZL2O60487 215 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 SFTPBP07988 381 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 FPR2P25090 351 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 HAAOP46952 286 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 TGM4P49221 684 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 BATF2Q8N1L9 274 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 CYGBQ8WWM9 190 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 UPRTQ96BW1 309 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 C4orf36Q96KX1 117 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 GAFA1Q96PS6 74 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PCGF1Q9BSM1 259 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ALG8Q9BVK2 526 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 SUCNR1Q9BXA5 334 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 KAAG1Q9UBP8 84 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 A0A0A6YYJ9 748 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 OR2AT4A6NND4 320 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 J3QT63 122 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 HTR1AP08908 422 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 GABRA2P47869 451 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 HILS1P60008 231 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 UBE2V2Q15819 145 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 DGUOKQ16854 277 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 CALHM1Q8IU99 346 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PELI1Q96FA3 418 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 RDH12Q96NR8 316 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ESM1Q9NQ30 184 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 NLKQ9UBE8 527 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ZNF879B4DU55 563 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 NDUFB3O43676 98 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 IGHA1P01876 353 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PGA5P0DJD9 388 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PPIAL4GP0DN37 164 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 PSG2P11465 335 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ARF6P62330 175 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ACTA2P62736 377 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-214ENST00000490425 ACTG2P63267 376 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms