RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480158.1

HERC4-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HERC4, Length 2,438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-210ENST00000480158 B9A039 149 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ANGPTL7O43827 346 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 CDC14BO60729 498 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 CD8AP01732 235 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 IGHV1-46P01743 117 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 PRF1P14222 555 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ATF1P18846 271 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 TNP2Q05952 138 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 MAB21L1Q13394 359 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 KISS1Q15726 138 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 IDNKQ5T6J7 187 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 TMEM42Q69YG0 159 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 Q6ZSR3 168 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 WDR86Q86TI4 376 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 CALHM1Q8IU99 346 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 OR2V2Q96R30 315 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 GAL3ST1Q99999 423 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 KCNK15Q9H427 330 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 BATF3Q9NR55 127 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 FAIMQ9NVQ4 179 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 CDIPTO14735 213 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 SLC22A1O15245 554 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 NDUFS7O75251 213 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 RHBDL1O75783 438 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ZNF205O95201 554 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 DANCRP0C864 163 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 TMEM225BP0DP42 221 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 LYNX1P0DP58 116 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 GALP22466 123 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 OR3A4PP47883 348 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 MTNR1BP49286 362 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 RBP2P50120 134 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 AKAP6Q13023 2319 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 P2RY14Q15391 338 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 AGAP6Q5VW22 663 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 USP43Q70EL4 1123 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 UTS2BQ765I0 119 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 OR10K1Q8NGX5 313 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 THRSPQ92748 146 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 C10orf35Q96D05 121 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ZNF488Q96MN9 340 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 MICU1Q9BPX6 476 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
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HERC4-210ENST00000480158 CBLN4Q9NTU7 201 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 DECR2Q9NUI1 292 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 FOXJ3Q9UPW0 622 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 V9GY05 133 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 C17orf100A8MU93 164 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 SYNGR1O43759 233 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 PAHP00439 452 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 FSTP19883 344 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 FUT6P51993 359 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 SNU13P55769 128 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ZNF154Q13106 437 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 MADCAM1Q13477 382 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 EFNB3Q15768 340 aa5.45□□□□□ -1.54
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HERC4-210ENST00000480158 OR10K2Q6IF99 312 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ZNF529Q6P280 563 aa5.45□□□□□ -1.54
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HERC4-210ENST00000480158 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.45□□□□□ -1.54
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HERC4-210ENST00000480158 ZNF611Q8N823 705 aa5.45□□□□□ -1.54
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HERC4-210ENST00000480158 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.45□□□□□ -1.54
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HERC4-210ENST00000480158 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 PHYHIPQ92561 330 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 FAM46BQ96A09 425 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 ING4Q9UNL4 249 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC4-210ENST00000480158 CACNG2Q9Y698 323 aa5.45□□□□□ -1.54
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