RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OR5B2	Q96R09	309 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	DERL2	Q9GZP9	239 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ALG9	Q9H6U8	611 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	NOX3	Q9HBY0	568 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	POLE3	Q9NRF9	147 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CD274	Q9NZQ7	290 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	EMC3	Q9P0I2	261 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OPTC	Q9UBM4	332 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	RNF14	Q9UBS8	474 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	EMCN	Q9ULC0	261 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CACNG2	Q9Y698	323 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912		A0A0U1RQV5	110 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PPIAL4D	F5H284	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	C3orf84	H3BNL1	204 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912		M0R233	179 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	UBXN8	O00124	270 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ERLIN1	O75477	346 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SCGB2A1	O75556	95 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	DIRAS3	O95661	229 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CRYBA1	P05813	215 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FCGR3A	P08637	254 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	RRAS	P10301	218 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	GABRA3	P34903	492 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MAP3K8	P41279	467 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CCL8	P80075	99 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TGFBR3	Q03167	851 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PCK2	Q16822	640 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ATRAID	Q6UW56	229 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CASP12	Q6UXS9	341 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	VSTM4	Q8IW00	320 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OR2L13	Q8N349	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	GPR119	Q8TDV5	335 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	RAB3C	Q96E17	227 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OR4F4	Q96R69	305 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SERPINI1	Q99574	410 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	RBBP8	Q99708	897 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	B9D2	Q9BPU9	175 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	DPH5	Q9H2P9	285 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SENP1	Q9P0U3	644 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PSME2	Q9UL46	239 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FZR1	Q9UM11	496 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912		U3KQV3	271 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PLXNB1	O43157	2135 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SULT2B1	O00204	365 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OR7A17	O14581	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	GPR171	O14626	319 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	EI24	O14681	340 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SUPT3H	O75486	399 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PIAS1	O75925	651 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	KCNK2	O95069	426 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	NUDT14	O95848	222 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	LGI1	O95970	557 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	AK1	P00568	194 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	IGHM	P01871	453 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	IL3	P08700	152 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	UMPS	P11172	480 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF19	P17023	458 aa		3.34	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms