RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V1G2	O95670	118 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ISG15	P05161	165 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	SRD5A1	P18405	259 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PITPNB	P48739	271 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ST3GAL4	Q11206	333 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TMEM42	Q69YG0	159 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZSR3	168 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	AHSA2	Q719I0	299 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	STX19	Q8N4C7	294 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	FGGY	Q96C11	551 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TECTB	Q96PL2	329 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	JAM3	Q9BX67	310 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CLN8	Q9UBY8	286 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ATR	Q13535	2644 aa		14.83	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	NDUFA2	O43678	99 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	RHBDL1	O75783	438 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CCDC159	P0C7I6	412 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OCM2	P0CE71	109 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	HAAO	P46952	286 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZNF573	Q86YE8	665 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	SEH1L	Q96EE3	360 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		14.82	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TMEM212	A6NML5	194 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	SRRM5	B3KS81	715 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS2	O15393	492 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	FAM157C	P0CG43	387 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	GLRA1	P23415	457 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CPT2	P23786	658 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CFHR2	P36980	270 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	RIPK1	Q13546	671 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	AQP3	Q92482	292 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	C10orf35	Q96D05	121 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	MDFI	Q99750	246 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CHST5	Q9GZS9	411 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	MMP26	Q9NRE1	261 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		14.81	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PTGES3L	E9PB15	166 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZFPL1	O95159	310 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	GATA3	P23771	443 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TGM4	P49221	684 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	UBE2V2	Q15819	145 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PP6455	Q8WZ26	134 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	CCL13	Q99616	98 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	SCN3B	Q9NY72	215 aa		14.8	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902		A8MXK9	166 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902		J3QLI3	93 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902		J3QT63	122 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	SYNGR1	O43759	233 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	PLAT	P00750	562 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	HSPA13	P48723	471 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	FUT6	P51993	359 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
USP19-210	ENST00000465902	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04

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