RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa16.02■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 HOXB5P09067 269 aa16.02■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 Q6ZSR3 168 aa16.02■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SLC6A15Q9H2J7 730 aa16.02■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SH2D2AQ9NP31 389 aa16.02■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CA11O75493 328 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 FOLR3P41439 243 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ECI1P42126 302 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGDIBP52566 201 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 MLF1P58340 268 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 S100A10P60903 97 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 RAB32Q13637 225 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF585AQ6P3V2 769 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 DRAM2Q6UX65 266 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 OR2AE1Q8NHA4 323 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 TMED6Q8WW62 240 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SGK3Q96BR1 496 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 RTTNQ86VV8 2226 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM77I1YAP6 450 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 FGF16O43320 207 aa16.01■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 RAC3P60763 192 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 RAB35Q15286 201 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 BHLHE23Q8NDY6 225 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SPSB1Q96BD6 273 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 METTL9Q9H1A3 318 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 C1orf123Q9NWV4 160 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.01■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 MSGN1A6NI15 193 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SFTPBP07988 381 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 LYL1P12980 280 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 RPS2P15880 293 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 RSU1Q15404 277 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SULF2Q8IWU5 870 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 GPR137CQ8N3F9 429 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 OR14L1PQ8NHC6 308 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 REEP6Q96HR9 211 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 Q96M66 194 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 AQP10Q96PS8 301 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CRLF2Q9HC73 371 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ACKR4Q9NPB9 350 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CYTL1Q9NRR1 136 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 DHRS7CA6NNS2 312 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 MASP2O00187 686 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 PLATP00750 562 aa16■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 CCDC157Q569K6 752 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 PLXDC2Q6UX71 529 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 OR51F2Q8NH61 342 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ARL11Q969Q4 196 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SGCZQ96LD1 299 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 OR2S2Q9NQN1 319 aa16■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 FRYLO94915 3013 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 DNPH1O43598 174 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 P04436 131 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ACKR3P25106 362 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 POC1AQ8NBT0 407 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 PRELID1Q9Y255 219 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ANGPTL7O43827 346 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ATG12O94817 140 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 LCATP04180 440 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CRYGSP22914 178 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 AKR1C2P52895 323 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CARD18P57730 90 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 AKR1C1Q04828 323 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF774Q6NX45 483 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 FAM219AQ8IW50 185 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 IER2Q9BTL4 223 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM100Q9NV29 134 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJB11Q9UBS4 358 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 EDARQ9UNE0 448 aa15.99■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SDK2Q58EX2 2172 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM218A2RU14 115 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 TOR1AO14656 332 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
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