RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 CDAP32320 146 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 OR3A4PP47883 348 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SLC6A9P48067 706 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CARD18P57730 90 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 OR8B8Q15620 311 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 LCE2CQ5TA81 110 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 OTPQ5XKR4 325 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 BAP18Q8IXM2 172 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 NABP1Q96AH0 204 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 TMEM45BQ96B21 275 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 AQP10Q96PS8 301 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SYT3Q9BQG1 590 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PECRQ9BY49 303 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PADI1Q9ULC6 663 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 MPTX1A8MV57 137 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 F5H5K5 113 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 STMND1H3BQB6 276 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 IFNA2P01563 188 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SERPINA7P05543 415 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CSN2P05814 226 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 COX5BP10606 129 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CRYGSP22914 178 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SERPINF1P36955 418 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 RBP2P50120 134 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 FUT6P51993 359 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ATP1B3P54709 279 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 UCP3P55916 312 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SMCO1Q147U7 214 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 HES3Q5TGS1 186 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 OR52W1Q6IF63 320 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 DHRS13Q6UX07 377 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 KCTD9Q7L273 389 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 TMEM104Q8NE00 496 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CMBLQ96DG6 245 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 SEC22AQ96IW7 307 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 IP6K3Q96PC2 410 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 RNF122Q9H9V4 155 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 BCO1Q9HAY6 547 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PROK2Q9HC23 129 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 TMEM100Q9NV29 134 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 POMT1Q9Y6A1 747 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 FAM186AA6NE01 2351 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-208ENST00000464611 A0A0A6YYD4 124 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.4 ms