RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420077.5

SEMA4F-204, Transcript of ssemaphorin 4F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4F, Length 2,192 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4F-204ENST00000420077 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ZNF716A6NP11 495 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 OTX2P32243 289 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 CARD18P57730 90 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 SULF2Q8IWU5 870 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 Q96M66 194 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 GPR173Q9NS66 373 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 PGAM2P15259 253 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 HGFACQ04756 655 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ZNF774Q6NX45 483 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 DCUN1D4Q92564 292 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 SPSB1Q96BD6 273 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 RNF126Q9BV68 326 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 TCFL5Q9UL49 500 aa14.66□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 KCNAB3O43448 404 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ADAP1O75689 374 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 SP9P0CG40 484 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ICAM2P13598 275 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 STPG2Q8N412 459 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 STOML3Q8TAV4 291 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 REEP6Q96HR9 211 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ADGRG7Q96K78 797 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 PRR13Q9NZ81 148 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 PCSK5Q92824 1860 aa14.65□□□□□ -0.06
SEMA4F-204ENST00000420077 FIGNL2A6NMB9 653 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 CNR1P21554 472 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 GABRR1P24046 479 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 MTCP1P56278 107 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 OR6C6A6NF89 314 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 F8VVB4 439 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 F8VWA3 439 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 H0YIZ8 118 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 CXCL13O43927 109 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 B4GALT1P15291 398 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 GLRA1P23415 457 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 AAED1Q7RTV5 226 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 PADI1Q9ULC6 663 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 R4GN57 208 aa14.64□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 MPTX1A8MV57 137 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 SERPINA5P05154 406 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 TMEM225BP0DP42 221 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 LYL1P12980 280 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 ZNF32P17041 273 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 ELP2Q6IA86 826 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 ESX1Q8N693 406 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 OR10D3Q8NH80 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 SLC39A7Q92504 469 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 GLS2Q9UI32 602 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 BET1O15155 118 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 ACP1P24666 158 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 ACER2Q5QJU3 275 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 METTL9Q9H1A3 318 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 DEPPQ9NTK1 212 aa14.63□□□□□ -0.07
SEMA4F-204ENST00000420077 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms