RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SHISA8B8ZZ34 492 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 H7C1Q1 480 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SPARCP09486 303 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CRABP1P29762 137 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKXP51817 358 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 F2RL1P55085 397 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM33P57088 247 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SHHQ15465 462 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8B8Q15620 311 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GAPTQ8N292 157 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SPSB4Q96A44 273 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HPF1Q9NWY4 346 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SPACA6W5XKT8 324 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 EML6Q6ZMW3 1958 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6C6A6NF89 314 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL12A8MUP2 240 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN9O75954 239 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM6P0DI80 62 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZP2Q05996 745 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC157Q569K6 752 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MUCL1Q96DR8 90 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRX2Q99811 253 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SLITRK2Q9H156 845 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 IL36GQ9NZH8 169 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN4O14493 209 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DEDDO75618 318 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 APOC1P02654 83 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PGCP20142 388 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP57Q9NU63 452 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf50Q96LR7 162 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR84Q9NQS5 396 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PKDREJQ9NTG1 2253 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PIAS2O75928 621 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GLRA1P23415 457 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SNCAP37840 140 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 NPBWR2P48146 333 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 EMP2P54851 167 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GMFBP60983 142 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF561Q8N587 486 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RLN3Q8WXF3 142 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV2-14P01704 120 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DRD1P21728 446 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 UCP1P25874 307 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVFRD-1P60508 538 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.14□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 SKA3Q8IX90 412 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC18Q8N456 261 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 C18orf12Q96KH6 178 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 GLRX2Q9NS18 164 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CREBBPQ92793 2442 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP7P3A6NL99 342 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF716A6NP11 495 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINE3A8MV23 424 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RENP00797 406 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSEP14091 401 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.14□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PMS2P11Q13670 270 aa3.14□□□□□ -1.91
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