RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 PPIAL4DF5H284 164 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 OCM2P0CE71 109 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 PPIAL4FP0DN26 164 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ATF1P18846 271 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 CFHR2P36980 270 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 C19orf18Q8NEA5 215 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC29Q8WV35 223 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 SMR3AQ99954 134 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM165Q9HC07 324 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 PPIAL4AQ9Y536 164 aa25.26■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 FUT6P51993 359 aa25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM249Q2WGJ8 235 aa25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ASPHD2Q6ICH7 369 aa25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 SPARTQ8N0X7 666 aa25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 OR13C9Q8NGT0 318 aa25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM106AQ96A25 262 aa25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa25.25■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ABCA2Q9BZC7 2435 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 RHBDL1O75783 438 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 FSTL3O95633 263 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 HSMCR30P0CW71 290 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 EGR1P18146 543 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 HAAOP46952 286 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 LMO4P61968 165 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF573Q86YE8 665 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 OR5D14Q8NGL3 314 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 AQP3Q92482 292 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ISYNA1Q9NPH2 558 aa25.24■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 CSPG4Q6UVK1 2322 aa25.23■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 CD2P06729 351 aa25.23■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 MDH2P40926 338 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 Q499Y3 187 aa25.23■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 CALHM1Q8IU99 346 aa25.23■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 OR10Z1Q8NGY1 313 aa25.23■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 MGLLQ99685 303 aa25.23■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 GAL3ST1Q99999 423 aa25.23■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ABCA1O95477 2261 aa25.23■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 C3orf80F5H4A9 247 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 CD80P33681 288 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 GPR50Q13585 617 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM155Q4W5P6 130 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF773Q6PK81 442 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ANGPTL5Q86XS5 388 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 DNAAF1Q8NEP3 725 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 BORCS8Q96FH0 119 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 OPALINQ96PE5 141 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 PCMT1P22061 227 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 KRTAP1-1Q07627 177 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 TPBGQ13641 420 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 LIPKQ5VXJ0 399 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF529Q6P280 563 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB108BQ8NET1 73 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 UFD1Q92890 307 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ORAI1Q96D31 301 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 OR14A2Q96R54 314 aa25.22■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 SRRM5B3KS81 715 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 AKR7A2O43488 359 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 SYNGR1O43759 233 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ALX3O95076 343 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 PRKACBP22694 351 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF404Q494X3 552 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF367Q7RTV3 350 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 SVOPQ8N4V2 548 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 SPSB1Q96BD6 273 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM246Q9BRR3 403 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF665Q9H7R5 613 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 TAS2R4Q9NYW5 299 aa25.21■■□□□ 1.63
PKDCC-202ENST00000401498 J3QT63 122 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 LGALS8O00214 317 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 SULT1B1O43704 296 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV4-31P0DP07 118 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 MPZP25189 248 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 RBP2P50120 134 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 RNF144BQ7Z419 303 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 SEH1LQ96EE3 360 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 WDR13Q9H1Z4 485 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TLN2Q9Y4G6 2542 aa25.2■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV2-5P01817 119 aa25.19■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 CPEP16870 476 aa25.19■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 SPICQ8N5J4 248 aa25.19■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 MS4A15Q8N5U1 240 aa25.19■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TSPAN14Q8NG11 270 aa25.19■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 OR51A2Q8NGJ7 313 aa25.19■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF671Q8TAW3 534 aa25.19■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TMED9Q9BVK6 235 aa25.19■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 OOEPA6NGQ2 149 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF879B4DU55 563 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms