RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC25A28Q96A46 364 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 EME1Q96AY2 570 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 NLKQ9UBE8 527 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 ALPLP05186 524 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 PSG2P11465 335 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 MPZP25189 248 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 CAV3P56539 151 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMED1Q13445 227 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 C16orf87Q6PH81 154 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM86BQ8N661 226 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 POC1AQ8NBT0 407 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 SDSLQ96GA7 329 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 USE1Q9NZ43 259 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1B0GVI7 797 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR2AT4A6NND4 320 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 J3QRE1 110 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 NDUFB3O43676 98 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 IL13RA1P78552 427 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 RELBQ01201 579 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 LHX4Q969G2 390 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 HES4Q9HCC6 221 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 DLGAP1O14490 977 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SYNGR1O43759 233 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 NRASP01111 189 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR2T7P0C7T2 308 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 PGA5P0DJD9 388 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GLRA1P23415 457 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 GMFBP60983 142 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF85Q03923 595 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 IKZF1Q13422 519 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 OR2T27Q8NH04 317 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 RORBQ92753 470 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBE2FQ969M7 185 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 MED30Q96HR3 178 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHIAQ9BZP6 476 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A0U1RQK1 487 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 J3QT63 122 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SULT1C4O75897 302 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 APOL3O95236 402 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 DLX1P56177 255 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERVK11-1P61568 191 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZSCAN26Q16670 478 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 HCP5Q6MZN7 132 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 MOB3CQ70IA8 216 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 CD177Q8N6Q3 437 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 TBX5Q99593 518 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 RASL12Q9NYN1 266 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-202ENST00000373162 EI24O14681 340 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms