RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 CT45A5P0DMU8 189 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CT45A7P0DMV0 189 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR12D1P0DN82 309 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALOX5APP20292 161 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAMLGP49069 296 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCT3P49368 545 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC18A1P54219 525 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPINK7P58062 85 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CBX1P83916 185 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEMG2Q02383 582 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD164Q04900 197 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELOCQ15369 112 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00303Q3SY05 128 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CT45A1Q5HYN5 189 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 C12orf54Q6X4T0 127 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q6ZSR3 168 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 UNC93AQ86WB7 457 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 BPIFCQ8NFQ6 507 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CT45A3Q8NHU0 189 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 PYURFQ96I23 114 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF170Q96K19 258 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALS2CR12Q96Q35 445 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 TEAD3Q99594 435 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SFXN3Q9BWM7 321 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSD3B7Q9H2F3 369 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDUFB11Q9NX14 153 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADAM28Q9UKQ2 775 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXL3Q9UKT7 428 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 USH1CQ9Y6N9 552 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 U3KQV3 271 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALPK2Q86TB3 2170 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 DISP1Q96F81 1524 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGF2RP11717 2491 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 A6NDN8 102 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 K7EPK0 472 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 GABRPO00591 440 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB5O15062 677 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSPHP1O15172 72 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERI3O43414 337 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 FLOT1O75955 427 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPINE2P07093 398 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGA4P0DJD7 388 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGA3P0DJD8 388 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGA5P0DJD9 388 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 HLA-DPA1P20036 260 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 HTR2CP28335 458 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFNA8P32881 189 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 PFN2P35080 140 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SP4Q02446 784 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCGB2A2Q13296 93 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITIH4Q14624 930 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 GCSAMLQ5JQS6 135 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ISLR2Q6UXK2 745 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF439Q8NDP4 499 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF555Q8NEP9 628 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDR9C7Q8NEX9 313 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5T3Q8NGG3 340 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2K2Q8NGT1 345 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5H2Q8NGV7 314 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2T34Q8NGX1 318 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2T3Q8NH03 318 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUBPLQ8TB37 319 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNF8Q96H20 258 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 COQ2Q96H96 371 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAPZA3Q96KX2 299 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFT74Q96LB3 600 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM111AQ96PZ2 611 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 NINJ2Q9NZG7 142 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 STK38LQ9Y2H1 464 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ASB3Q9Y575 518 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRP2P98164 4655 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNIKQ9UKE5 1360 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0D9SG42 100 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPAN11A1L157 253 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 AP3B1O00203 1094 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 LECT2O14960 151 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH2D1AO60880 128 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 POP7O75817 140 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 UGT2B4P06133 528 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 MLNP12872 115 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD36P16671 472 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP6V1C1P21283 382 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-170P-201ENST00000362832 BCKDHBP21953 392 aa-0.68□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms