RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	DMD	P11532	3685 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LRP3	O75074	770 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NPIPB7	O75200	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	WISP1	O95388	367 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ABHD16A	O95870	558 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MT-CO3	P00414	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	HTR2C	P28335	458 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MSX1	P28360	303 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PTGDS	P41222	190 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NUBP1	P53384	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	HNF4G	Q14541	408 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659		Q96M85	177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TCAP	O15273	167 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SCGN	O76038	276 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	JTB	O76095	146 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MT-ATP6	P00846	226 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFB7	P17568	137 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TCN2	P20062	427 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	KDM8	Q8N371	416 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RASD2	Q96D21	266 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	EFS	O43281	561 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TGOLN2	O43493	480 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TSPAN15	O95858	294 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TXNDC12	O95881	172 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	VAMP1	P23763	118 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RAP1A	P62834	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FAM3A	P98173	230 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RSU1	Q15404	277 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659		Q6ZRG5	221 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF627	Q7L945	461 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	BIVM	Q86UB2	503 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CT55	Q8WUE5	264 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ISOC2	Q96AB3	205 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RHOV	Q96L33	236 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	YPEL4	Q96NS1	127 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CKLF	Q9UBR5	152 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf172	C9J069	976 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659		C9JQL5	133 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TP53I11	O14683	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R2P9	O14990	202 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	F13B	P05160	661 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RAB6A	P20340	208 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SNCA	P37840	140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	EMC4	Q5J8M3	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	OPN5	Q6U736	354 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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