RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	FAM157B	P0CG42	384 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	NAT2	P11245	290 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	COX6B1	P14854	86 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	HOXC12	P31275	282 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	OR3A4P	P47883	348 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	PTH2R	P49190	550 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ZP1	P60852	638 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	PPP1CB	P62140	327 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	MALL	Q13021	153 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	UNC119	Q13432	240 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	KISS1	Q15726	138 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	TAB1	Q15750	504 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	STEAP3	Q658P3	488 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	OR10K2	Q6IF99	312 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	C16orf87	Q6PH81	154 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	FJX1	Q86VR8	437 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	PIGT	Q969N2	578 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ITFG2	Q969R8	447 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	HAVCR1	Q96D42	359 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	C14orf79	Q96F83	325 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ABHD1	Q96SE0	405 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC32	Q9BV29	185 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	OPA3	Q9H6K4	179 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	CDH20	Q9HBT6	801 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	FAM221A	A4D161	298 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	CD300LB	A8K4G0	201 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	CCL21	O00585	134 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	CTAG2	O75638	210 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	KDM4B	O94953	1096 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	BPNT1	O95861	308 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	CST4	P01036	141 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	HLA-DQB1	P01920	261 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	THBD	P07204	575 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	VSIG8	P0DPA2	414 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	IL7	P13232	177 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ARSB	P15848	533 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	CDK2	P24941	298 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	MNDA	P41218	407 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ALDH3B1	P43353	468 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	PITPNB	P48739	271 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	MMP15	P51511	669 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF83	P51522	516 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ART1	P52961	327 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	UCP2	P55851	309 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	KRTAP10-9	P60411	292 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	NAAA	Q02083	359 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	IL18	Q14116	193 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	PPA1	Q15181	289 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	MSMP	Q1L6U9	139 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	PYDC2	Q56P42	97 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	MOB3C	Q70IA8	216 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	PIGC	Q92535	297 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	PTX4	Q96A99	478 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	RFT1	Q96AA3	541 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	SPSB1	Q96BD6	273 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	CCDC120	Q96HB5	630 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	OR10A4	Q9H209	315 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	GPR160	Q9UJ42	338 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PVT1-222	ENST00000613916	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41

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