RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	DNHD1	Q96M86	4753 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	DYSF	O75923	2080 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR5B21	A6NL26	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256		F5H5P2	479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	IGHV1-46	P01743	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MAS1	P04201	325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	PRKACB	P22694	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	KRT74	Q7RTS7	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SPERT	Q8NA61	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	RNF170	Q96K19	258 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CCL19	Q99731	98 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TACC2	O95359	2948 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	MAGEB3	O15480	346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CD8A	P01732	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SRM	P19623	302 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	BDKRB2	P30411	391 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	GPM6A	P51674	278 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SPSB1	Q96BD6	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ROS1	P08922	2347 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A1B0GWJ7	208 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ADH4	P08319	380 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	CDKN1A	P38936	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	FUT6	P51993	359 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	TMBIM6	P55061	237 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	VBP1	P61758	197 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	NCS1	P62166	190 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	GNG3	P63215	75 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM209A	Q5JX71	171 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2V2	Q96R30	315 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	DECR2	Q9NUI1	292 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256		A6NLC8	198 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	PDCD5	O14737	125 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ALX3	O95076	343 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	CD55	P08174	381 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	THBS2	P35442	1172 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	TGFBR1	P36897	503 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	CD200	P41217	278 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ATP1B3	P54709	279 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	CCL8	P80075	99 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	TESK1	Q15569	626 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	CTF1	Q16619	201 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	SPACA5	Q96QH8	159 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	GPER1	Q99527	375 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	IL19	Q9UHD0	177 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LTBP4-222	ENST00000598256	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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