RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 POMPQ9Y244 141 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PN81 502 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 DHRS12A0PJE2 317 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF726A6NNF4 738 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 M0R3G1 203 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CLOCKO15516 846 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 XPNPEP2O43895 674 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 STAMBPO95630 424 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IGF2P01344 180 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TSPAN19P0C672 248 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CHRNA7P36544 502 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OMPP47874 163 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CDH11P55287 796 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 GMFBP60983 142 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CHRNB3Q05901 458 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ZP4Q12836 540 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 GABRA6Q16445 453 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TUBA1AQ71U36 451 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OAFQ86UD1 273 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SPATA24Q86W54 205 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 LIPHQ8WWY8 451 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 GGHQ92820 318 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SAMD8Q96LT4 415 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 GPA33Q99795 319 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TRIM15Q9C019 465 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 INIPQ9NRY2 104 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 AURKCQ9UQB9 309 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 U3KQV3 271 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PRG6 482 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR5H1A6NKK0 313 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OVOL3O00110 214 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR10H3O60404 316 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CIB2O75838 187 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV4-39P01824 125 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PGA4P0DJD7 388 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 PGA3P0DJD8 388 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 DAOP14920 347 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ACVR1BP36896 505 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CSNK1A1P48729 337 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 FXYD6P3P58550 94 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 MYBPC1Q00872 1141 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 WDR31Q8NA23 367 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SYT14Q8NB59 555 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 RFT1Q96AA3 541 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 CRLF2Q9HC73 371 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 H7C1C5 153 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TNFRSF11BO00300 401 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 SLC2A10O95528 541 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 IGHMP01871 453 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 B4GALT1P15291 398 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4D-210ENST00000588972 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms