RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CACNA1CQ13936 2221 aa4.43□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 MED13LQ71F56 2210 aa4.43□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.43□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 POLQO75417 2590 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 SNTNA6NMZ2 147 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ICOSLGO75144 302 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 EEDO75530 441 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PIAS1O75925 651 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 KLHL2O95198 593 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 AIFM1O95831 613 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CLPSP04118 112 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CRHP06850 196 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 KLK1P06870 262 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PHBP35232 272 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 MAP3K8P41279 467 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 MAGEA8P43361 318 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PPICP45877 212 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 STARP49675 285 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PLTPP55058 493 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 FBXW4P57775 412 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 IFT88Q13099 833 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ASAH1Q13510 395 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 BCL2A1Q16548 175 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 OR4F3Q6IEY1 312 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CMC1Q7Z7K0 106 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA4Q8NEY3 305 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 TPD52L3Q96J77 140 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 METTL7AQ9H8H3 244 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 B3GNT2Q9NY97 397 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF639Q9UID6 485 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PYCARDQ9ULZ3 195 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 RNF11Q9Y3C5 154 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 LRBAP50851 2863 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 FBN2P35556 2912 aa4.42□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 FRG2CA6NGY1 282 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 OR6C70A6NIJ9 312 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 SULT2B1O00204 365 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 RAD51CO43502 376 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CXCL13O43927 109 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 SMIM24O75264 130 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 OTCP00480 354 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CT62P0C5K7 136 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 SERPINB8P50452 374 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CCNG1P51959 295 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ACTR3P61158 418 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PLCXD2Q0VAA5 305 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM16LQ309B1 348 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ATAD3CQ5T2N8 411 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 OR2A2Q6IF42 318 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 SLC48A1Q6P1K1 146 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PLCZ1Q86YW0 608 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CDH26Q8IXH8 852 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 RNF175Q8N4F7 328 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 RHOXF1Q8NHV9 184 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 LINC01560Q8TB33 94 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 DOK4Q8TEW6 326 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 KCTD4Q8WVF5 259 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 GTSF1Q8WW33 167 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 HGDQ93099 445 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 TM4SF18Q96CE8 201 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 IL4I1Q96RQ9 567 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PAXXQ9BUH6 204 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CES1P1Q9UKY3 287 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.4□□□□□ -1.7
TMOD3-208ENST00000560725 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms