RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558285.5

USP3-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-208ENST00000558285 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 SCN1BQ07699 218 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 CLLU1Q5K131 121 aa7.37□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.37□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 STARD10Q9Y365 291 aa7.37□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 GMDSO60547 372 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 FOXH1O75593 365 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 CDC42P60953 191 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 CDK5Q00535 292 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 POU4F2Q12837 409 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 FAHD1Q6P587 224 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 KRT77Q7Z794 578 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.36□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 MSL2Q9HCI7 577 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 I3L521 148 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 ZP3P21754 424 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 THBS2P35442 1172 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 PRR20CP86479 221 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 PRR20BP86481 221 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 PRR20AP86496 221 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 CPOQ8IVL8 374 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-208ENST00000558285 OR8S1Q8NH09 359 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 THEM6Q8WUY1 208 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 PGAM5Q96HS1 289 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-208ENST00000558285 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.35□□□□□ -1.23
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