RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556517.1

ABCD4-225, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-225	ENST00000556517	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	KCTD7	Q96MP8	289 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	GPER1	Q99527	375 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	OR51E2	Q9H255	320 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	LIME1	Q9H400	295 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	MEGF11	A6BM72	1044 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	LRRC30	A6NM36	301 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	OVOL3	O00110	214 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PDCD5	O14737	125 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	GPX5	O75715	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	CYB5A	P00167	134 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	MAS1	P04201	325 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	IRF2	P14316	349 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	EFNA4	P52798	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ATP5J2	P56134	94 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	HFE	Q30201	348 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	DDI2	Q5TDH0	399 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	HPS1	Q92902	700 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	NINJ1	Q92982	152 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ORAI1	Q96D31	301 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	CCDC160	A6NGH7	325 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PIN1P1	O15428	100 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	DAO	P14920	347 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	THBS2	P35442	1172 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	RANBP1	P43487	201 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	GATA4	P43694	442 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	HAAO	P46952	286 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PSMD7	P51665	324 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	KISS1	Q15726	138 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ZNF529	Q6P280	563 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	CDH24	Q86UP0	819 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PERP	Q96FX8	193 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	CAD	P27708	2225 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	CDC14B	O60729	498 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	NCR1	O76036	304 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	GABARAP	O95166	117 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PLAT	P00750	562 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ALDOB	P05062	364 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	MTNR1B	P49286	362 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	POU3F4	P49335	361 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ZNF154	Q13106	437 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	BLMH	Q13867	455 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	CDH26	Q8IXH8	852 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ABCD4-225	ENST00000556517	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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