RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 NDNFQ8TB73 568 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 KCTD7Q96MP8 289 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 DACH2Q96NX9 599 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 OPA3Q9H6K4 179 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 NGBQ9NPG2 151 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 NOX4Q9NPH5 578 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.89□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 A6NIN4 97 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ABCD4O14678 606 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ARL6IP5O75915 188 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 AMY2AP04746 511 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CD2P06729 351 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 AMY2BP19961 511 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 TUBG1P23258 451 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 MPV17P39210 176 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 PEX19P40855 299 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SERPINB10P48595 397 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 PGAP1Q75T13 922 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ACBD4Q8NC06 268 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ITFG2Q969R8 447 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 FGGYQ96C11 551 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 C10orf35Q96D05 121 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 A0A1W2PPW3 197 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 GGT3PA6NGU5 568 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CD300LBA8K4G0 201 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SHISA9B4DS77 424 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 J3QKU1 62 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CDRT1O95170 752 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 IL1AP01583 271 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SRMP19623 302 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 MYL9P24844 172 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SDC2P34741 201 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 THBS4P35443 961 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 GLRXP35754 106 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 GNALP38405 381 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 DDOSTP39656 456 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 KIR2DL3P43628 341 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 MTNR1BP49286 362 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 BEX5Q5H9J7 111 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CEP78Q5JTW2 689 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 TMEM42Q69YG0 159 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 ZNF529Q6P280 563 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 USP43Q70EL4 1123 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 KRT74Q7RTS7 529 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 NUP37Q8NFH4 326 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 PP6455Q8WZ26 134 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 HAVCR1Q96D42 359 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 CMBLQ96DG6 245 aa6.87□□□□□ -1.31
BEST3-211ENST00000552295 RADILQ96JH8 1075 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms