RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 PSMB10P40306 273 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 CLLU1Q5K131 121 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 Q6ZR03 302 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR6S1Q8NH40 331 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR51E2Q9H255 320 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 HHATLQ9HCP6 504 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 DYSFO75923 2080 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 E9PQ18 207 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TSPAN4O14817 238 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PLPP2O43688 288 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RENP00797 406 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MT-ATP6P00846 226 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF92Q03936 586 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZP4Q12836 540 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 LY6EQ16553 131 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 BAK1Q16611 211 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 COMMD7Q86VX2 200 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MARC2Q969Z3 335 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 C7orf34Q96L11 122 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OPALINQ96PE5 141 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 SLC6A7Q99884 636 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 DLL4Q9NR61 685 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 B9D1Q9UPM9 204 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 H7C417 338 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 B3GALNT1O75752 331 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 CCNB2O95067 398 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 HMGN1P05114 100 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 CDK1P06493 297 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF35P13682 527 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 NDUFB7P17568 137 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OMPP47874 163 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF79Q15937 498 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ST7LQ8TDW4 575 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 CCL13Q99616 98 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF254O75437 659 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 UBL3O95164 117 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 C3orf56Q8N813 242 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ENKURQ8TC29 256 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 NINJ1Q92982 152 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GLS2Q9UI32 602 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 METRNQ9UJH8 293 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ALG5Q9Y673 324 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 M0R135 149 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MYL12BO14950 172 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RGS5O15539 181 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ADAM20O43506 726 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PAHP00439 452 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RHCEP18577 417 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MYL12AP19105 171 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms