RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 AGTR1P30556 359 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 S100A3P33764 101 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 CDKN2DP55273 166 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 MAXP61244 160 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 RPL38P63173 70 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2F1Q13607 317 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC10A1Q14973 349 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 TGIF1Q15583 401 aa3.41□□□□□ -1.86
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RABGGTB-210ENST00000485459 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 ACTBL2Q562R1 376 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 KHDC3LQ587J8 217 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.41□□□□□ -1.86
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RABGGTB-210ENST00000485459 C12orf73Q69YU5 71 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 HBMQ6B0K9 141 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 MED27Q6P2C8 311 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 ULK3Q6PHR2 472 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF546Q86UE3 836 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 IQCHQ86VS3 1027 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 AMZ2Q86W34 360 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 C10orf111Q8N326 155 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 ACBD4Q8NC06 268 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 OR7G2Q8NG99 324 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 OR11G2Q8NGC1 345 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM151AQ8WW52 585 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 LCN9Q8WX39 176 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 ING5Q8WYH8 240 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 OR8D1Q8WZ84 308 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 GALNT14Q96FL9 552 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 C12orf42Q96LP6 360 aa3.41□□□□□ -1.86
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RABGGTB-210ENST00000485459 CLMPQ9H6B4 373 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 TUBA4BQ9H853 241 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
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RABGGTB-210ENST00000485459 CD84Q9UIB8 345 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 NEU3Q9UQ49 428 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 RASD1Q9Y272 281 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 KPTNQ9Y664 436 aa3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-210ENST00000485459 STYXL1Q9Y6J8 313 aa3.41□□□□□ -1.86
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RABGGTB-210ENST00000485459 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM129A0AVI4 362 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5H15A6NDH6 313 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR5H1A6NKK0 313 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 IDSB3KWA1 339 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TRDCB7Z8K6 153 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM238C9JI98 176 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 F8WDY8 70 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 H0Y8G0 127 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 M0R036 132 aa3.4□□□□□ -1.87
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RABGGTB-210ENST00000485459 TGOLN2O43493 480 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF13O43567 381 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 GMFGO60234 142 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR10H3O60404 316 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 CLDN11O75508 207 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 REM1O75628 298 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 UBL3O95164 117 aa3.4□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 C8GP07360 202 aa3.4□□□□□ -1.87
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