RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 RGCCQ9H4X1 137 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 M0R036 132 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SELLP14151 372 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 FOSL2P15408 326 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 RAB5CP51148 216 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 PYY3Q5JQD4 70 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 TERB2Q8NHR7 220 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa15.93■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 IFITM10A6NMD0 228 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 EFNA2O43921 213 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ARG1P05089 322 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 HEXBP07686 556 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 KMT5CQ86Y97 462 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 C2orf50Q96LR7 162 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SPACA1Q9HBV2 294 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 KLRF1Q9NZS2 232 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 GPR132Q9UNW8 380 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SPEGQ15772 3267 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ST8SIA5O15466 376 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 CST4P01036 141 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 HKR1P10072 659 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SULT1A1P50225 295 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 DEFA6Q01524 100 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 Q3ZCU0 254 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 CDPF1Q6NVV7 123 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SLC25A45Q8N413 288 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 OR2I1PQ8NGU4 316 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 OR4K15Q8NH41 348 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 RAB3CQ96E17 227 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 KLHL13Q9P2N7 655 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 B3GAT1Q9P2W7 334 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.92■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 A0A1W2PPE2 198 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 CEACAM18A8MTB9 384 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 LY86O95711 162 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 OPN1LWP04000 364 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 NPY4RP50391 375 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 C1QL4Q86Z23 238 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 OR51E1Q8TCB6 317 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SGK3Q96BR1 496 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 PCED1AQ9H1Q7 454 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 MTCH2Q9Y6C9 303 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 LAMA1P25391 3075 aa15.91■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 A0A1W2PNV4 684 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 GPR37O15354 613 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 HOXB5P09067 269 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 PET100P0DJ07 73 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 PI3P19957 117 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 HOXA5P20719 270 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 S100A10P60903 97 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 MYBPHQ13203 477 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 OR2A2Q6IF42 318 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 OPA3Q9H6K4 179 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 YIF1AO95070 293 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ZNF20P17024 532 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 MAS1LP35410 378 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SNCAP37840 140 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 CLRN1P58418 232 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SPEM2Q0P670 501 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 RNF144BQ7Z419 303 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ZNF101Q8IZC7 436 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SLC38A9Q8NBW4 561 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SPACA5Q96QH8 159 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.9■□□□□ 0.14
SSR4-209ENST00000482902 SCGNO76038 276 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 IFNA2P01563 188 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 RNF224P0DH78 156 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 ITGA3P26006 1051 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 THBS4P35443 961 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 THEM4Q5T1C6 240 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 ZNF529Q6P280 563 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 UEVLDQ8IX04 471 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 YPEL4Q96NS1 127 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 NICN1Q9BSH3 213 aa15.89■□□□□ 0.13
SSR4-209ENST00000482902 ZNF576Q9H609 170 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms