RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 CIB2O75838 187 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 GATBO75879 557 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 TGM6O95932 706 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 PFN1P07737 140 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 PGA4P0DJD7 388 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 PGA3P0DJD8 388 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 RAB9AP51151 201 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 OPN5Q6U736 354 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 OR1L1Q8NH94 360 aa2.83□□□□□ -1.96
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SGCE-210ENST00000472326 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ACP6Q9NPH0 428 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 RGS18Q9NS28 235 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 PTTG3PQ9NZH4 202 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 NLRC5Q86WI3 1866 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 LRRC37A3O60309 1634 aa2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 NME4O00746 187 aa2.82□□□□□ -1.96
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SGCE-210ENST00000472326 RAB4AP20338 218 aa2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 PRKACBP22694 351 aa2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 GALR1P47211 349 aa2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.82□□□□□ -1.96
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SGCE-210ENST00000472326 DYNLL2Q96FJ2 89 aa2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 OR4K3Q96R72 315 aa2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 DCAF16Q9NXF7 216 aa2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa2.82□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 CD160O95971 181 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 HTR1DP28221 377 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 TAS2R43P59537 309 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 PRRC1Q96M27 445 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 KCNS3Q9BQ31 491 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 HES2Q9Y543 173 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 BCL9O00512 1426 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ERBINQ96RT1 1412 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 NHSQ6T4R5 1651 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 BTAF1O14981 1849 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 NRXN1Q9ULB1 1477 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 CRB1P82279 1406 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
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SGCE-210ENST00000472326 HRES1P13985 223 aa2.8□□□□□ -1.96
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SGCE-210ENST00000472326 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ALS2Q96Q42 1657 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 IQGAP3Q86VI3 1631 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 UBN2Q6ZU65 1347 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 H7C0C1 242 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 RAD1O60671 282 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 WBP4O75554 376 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 IGLV2-8P01709 118 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 TCP1P17987 556 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 PFN2P35080 140 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ATP5OP48047 213 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 LRRC66Q68CR7 880 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 CD300LGQ6UXG3 332 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 HORMAD1Q86X24 394 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 CDH26Q8IXH8 852 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 DRAM1Q8N682 238 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 CDS1Q92903 461 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 TOLLIPQ9H0E2 274 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ZNF160Q9HCG1 818 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 COL18A1P39060 1754 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 CLTCL1P53675 1640 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 SBF1O95248 1867 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ZNF878C9JN71 531 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 M0R3G1 203 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 CCNB2O95067 398 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 ILKQ13418 452 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 SMIM5Q71RC9 77 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 UBAC2Q8NBM4 344 aa2.78□□□□□ -1.96
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