RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PRF3 423 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PRM7 423 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM210A6NLX4 147 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3BN98 237 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMD9O00233 223 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPFFO15130 113 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR37O15354 613 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIGLEC5O15389 551 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFB3O43676 98 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPAN9O75954 239 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CST1P01037 141 aa6.9□□□□□ -1.3
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CRYBA1P05813 215 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 H2BFMP0C1H6 154 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSG2P11465 335 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRKACGP22612 351 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAX6P26367 422 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SAA4P35542 130 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAV3P56539 151 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL5RAQ01344 420 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 GK3PQ14409 553 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPOQ8IVL8 374 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 THEM6Q8WUY1 208 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIGCQ92535 297 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 MICU1Q9BPX6 476 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHID1Q9BWS9 393 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 MMP27Q9H306 513 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR51I2Q9H344 312 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGCCQ9H4X1 137 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SP140LQ9H930 580 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM206AQ9NX38 181 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 COPS3Q9UNS2 423 aa6.9□□□□□ -1.3
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0U1RQV5 110 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2AT4A6NND4 320 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBP1P09467 338 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 OSMP13725 252 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 CALB2P22676 271 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNALP38405 381 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPM6AP51674 278 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP78Q5JTW2 689 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 OTULINQ96BN8 352 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF170Q96K19 258 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1orf21Q9H246 121 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 NLKQ9UBE8 527 aa6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 AQP12BA6NM10 295 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF732B4DXR9 585 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 M0R1W7 72 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIMM23O14925 209 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYNGR1O43759 233 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTRP02766 147 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLRA1P23415 457 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 POU1F1P28069 291 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 MNAT1P51948 309 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2E1P51965 193 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 GUCA2AQ02747 115 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOFQ13790 326 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZSR3 168 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD177Q8N6Q3 437 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 AQP3Q92482 292 aa6.88□□□□□ -1.31
GAPDHP28-201ENST00000455134 RORBQ92753 470 aa6.88□□□□□ -1.31
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