RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 AURKCQ9UQB9 309 aa3.72□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.72□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.72□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa3.72□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS37A4D1T9 235 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CENPBD1B2RD01 187 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RER1O15258 196 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCTN3O75935 186 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPPPO94811 219 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTHP01270 115 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMG1P04279 462 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 FABP3P05413 133 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 GYPBP06028 91 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSMBP08118 114 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CST2P09228 141 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TACSTD2P09758 323 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN19P0C672 248 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF250P15622 560 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANOS1P23352 680 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAX7P23759 505 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PYCR1P32322 319 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAD52P43351 418 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OMPP47874 163 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCN2P80188 198 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 AQP6Q13520 282 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF718Q3SXZ3 478 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4K13Q8NH42 304 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51F2Q8NH61 342 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ITLN1Q8WWA0 313 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIPHQ8WWY8 451 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL17Q92583 94 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RDH5Q92781 318 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM186Q96B77 213 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 C7orf34Q96L11 122 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAMD8Q96LT4 415 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSMCE2Q96MF7 247 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBP7Q96R05 134 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDRT15Q96T59 188 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 NMNAT3Q96T66 252 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTBD10Q9BSF8 475 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR52D1Q9H346 318 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIAEQ9HAT2 523 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 VNN3Q9NY84 501 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 U3KQV3 271 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.71□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PRQ8 180 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 TVP23AA6NH52 213 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 M0QZ24 198 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFAB1O14561 156 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 PNPP00491 289 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 RENP00797 406 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGF2P01344 180 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV3-13P01766 116 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV2-5P01817 119 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.7□□□□□ -1.82
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLUP10909 449 aa3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms